10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 Contig_1 CCATACCTCTCCACTTCTTCCTCTTTCCCTTTACAATTTTTATTTTTTTTAAATAATAAAGTGATGATTTATTTATTGGTTAAAGAGGAAAATCCTCACA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CCATACCTCTCCACTTCTTCCTCTTTCCCTTTACAATTTTTATTTTTTTTAAATAATAAAGTGATGATTTATTTATTGGTTAAAGAGGAAAATCCTCACA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q CCATACCTCTCCACTTCTTCCTCTTTCCCTTTACAATTTTTATTTTTTTTAAATAATAAAGTGATGATTTATTTATTGGTTAAAGAGGAAAATCCTCACA Contig1S7cDNA CCATACCTCTCCACTTCTTCCTCTTTCCCTTTACAATTTTTATTTTTTTTAAATAATAAAGTGATGATTTATTTATTGGTTAAAGAGGAAAATCCTCACA S7 4000 C1q CCATACCTCTCCACTTCTTCCTCTTTCCCTTTACAATTTTTATTTTTTTTAAATAATAAAGTGATGATTTATTTATTGGTTAAAGAGGAAAATCCTCACA 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 Contig_1 TCACAGAATGGTGCTGTCCTCACACAGGGAAGAGCAGGAAGCCACTGAAGGTGTTGTGGTTATCATGGCTATCATGGAGACCCTGGTCTTCAGGGAGACG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TCACAGAATGGTGCTGTCCTCACACAGGGAAGAGCAGGAAGCCACTGAAGGTGTTGTGGTTATCATGGCTATCATGGAGACCCTGGTCTTCAGGGAGACG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q TCACAGAATGGTGCTGTCCTCACACAGGGAAGAGCAGGAAGCCACTGAAGGTGTTGTGGTTATCATGGCTATCATGGAGACCCTGGTCTTCAGGGAGACG Contig1S7cDNA TCACAGAATGGTGCTGTCCTCACACAGGGAAGAGCAGGAAGCCACTGAAGGTGTTGTGGTTATCATGGCTATCATGGAGACCCTGGTCTTCAGGGAGACG S7 4000 C1q TCACAGAATGGTGCTGTCCTCACACAGGGAAGAGCAGGAAGCCACTGAAGGTGTTGTGGTTATCATGGCTATCATGGAGACCCTGGTCTTCAGGGAGACG 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 Contig_1 AAGGTAGACCACATCCTCCTTCTCCAGCTCTAGTGTCAACGCATTAGATATGTACTGCCAACCCCCAACTGTATTTCTTTCTACATTATATAGAACTCTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: AAGGTAGACCACATCCTCCTTCTCCAGCTCTAGTGTCAACGCATTAGATATGTACTGCCAACCCCCAACTGTATTTCTTTCTACATTATATAGAACTCTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q AAGGTAGACCACATCCTCCTTCTCCAGCTCTAGTGTCAACGCATTAGATATGTACTGCCAACCCCCAACTGTATTTCTTTCTACATTATATAGAACTCTT Contig1S7cDNA AAGGTAGACCACATCCTCCTTCTCCAGCTCTAGTGTCAACGCATTAGATATGTACTGCCAACCCCCAACTGTATTTCTTTCTACATTATATAGAACTCTT S7 4000 C1q AAGGTAGACCACATCCTCCTTCTCCAGCTCTAGTGTCAACGCATTAGATATGTACTGCCAACCCCCAACTGTATTTCTTTCTACATTATATAGAACTCTT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 Contig_1 TGATTATTGTGAAACATCATGATGCCCATGAGTTGTGGGTGGCGGGATGACATGGCCGTGAATCTGAAGAAGTAGACTCCTTTCACTGATGCTGTGAAGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TGATTATTGTGAAACATCATGATGCCCATGAGTTGTGGGTGGCGGGATGACATGGCCGTGAATCTGAAGAAGTAGACTCCTTTCACTGATGCTGTGAAGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q TGATTATTGTGAAACATCATGATGCCCATGAGTTGTGGGTGGCGGGATGACATGGCCGTGAATCTGAAGAAGTAGACTCCTTTCACTGATGCTGTGAAGA Contig1S7cDNA TGATTATTGTGAAACATCATGATGCCCATGAGTTGTGGGTGGCGGGATGACATGGCCGTGAATCTGAAGAAGTAGACTCCTTTCACTGATGCTGTGAAGA S7 4000 C1q TGATTATTGTGAAACATCATGATGCCCATGAGTTGTGGGTGGCGGGATGACATGGCCGTGAATCTGAAGAAGTAGACTCCTTTCACTGATGCTGTGAAGA 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 Contig_1 TGCCTGCATCAGAGGAGAAATAGAGTGATATCAGCACTGTCTGTCTCATGTTGCTGTAGCTTTAATGTTTTTAACAAATAAACTCAGCAAAAAAAGAAAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TGCCTGCATCAGAGGAGAAATAGAGTGATATCAGCACTGTCTGTCTCATGTTGCTGTAGCTGGAATGTTTTTAACAAATAAACTCAGCAAAAAAAGAAAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q TG Contig1S7cDNA TG S7 4000 C1q TGCCTGCATCAGAGGAGAAATAGAGTGATATCAGCACTGTCTGTCTCATGTTGCTGTAGCTGGAATGTTTTTAACAAATAAACTCAGCAAAAAAAGAAAT 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 Contig_1 GTCCCTTTTCAGGACCCTGTCTTTCAAAGATAATTCGTAAAAATCCAAATAACTTCACAGATCTTCATTTTAAAGGGTTTAAACACTGTTTCCCATGCTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTCCCTTTTCAGGACCCTGTCTTTCAAAGATAATTCGTAAAAATCCAAATAACTTCACAGATCTTCATTTTAAAGGGTTTAAACACTGTTTCCCATGCTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GTCCCTTTTCAGGACCCTGTCTTTCAAAGATAATTCGTAAAAATCCAAATAACTTCACAGATCTTCATTTTAAAGGGTTTAAACACTGTTTCCCATGCTT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 Contig_1 CTTCAATGAACCATAAACAATTAATGAACATGCACCTGTGGAACGGTCGTTAAGACACTAACAGCTTACAGACGGTAGGCAGTTAGGCCAAAGTTATGAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CTTCAATGAACCATAAACAATTAATGAACATGCACCTGTGGAACGGTCGTTAAGACACTAACAGCTTACAGACGGTAGGCAGTTAGGCCAAAGTCATGAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q CTTCAATGAACCATAAACAATTAATGAACATGCACCTGTGGAACGGTCGTTAAGACACTAACAGCTTACAGACGGTAGGCAGTTAGGCCAAAGTCATGAA 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 Contig_1 AACTTAGGACACTAAAGAGGCCTTTCTACTGACACTGAAAAACACCAAAAGAAAGATGTCCAGGGTCCCTGCTCATCTGCAGGAACGTGCCTTAGACATG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: AACTTAGGACACTAAAGAGGCCTTTCTACTGACACTGAAAAACACCGAAAGAAAGATGTCCAGGGTCCCTGCTCATCTGCAGGAACGTGCCTTAGACATG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q AACTTAGGACACTAAAGAGGCCTTTCTACTGACACTGAAAAACACCGAAAGAAAGATGTCCAGGGTCCCTGCTCATCTGCAGGAACGTGCCTTAGACATG 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 Contig_1 CTGCAAGGAGGCATGAGGACTACAGATGTGGCCAGGGCAATAAATTGCAATGTCCGTACTGTGAGACACCTAACACAGCGCTACAGGGAGACAGGACGGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CTGCAAGGAGGCATGAGGACTACAGATGTGGCCAGGGCAATAAATTGCAATGTCCGTACAGTGAGACACCTAACACAGCGCTACAGGGAGACAGGACGGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q CTGCAAGGAGGCATGAGGACTACAGATGTGGCCAGGGCAATAAATTGCAATGTCCGTACAGTGAGACACCTAACACAGCGCTACAGGGAGACAGGACGGA 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 Contig_1 CAGCTGATCGTCCTCGCAGTGACAGACCACGTGTAACAACACCTGCACAGGATCGGTACATCCGAACATCACACCTGCGGGACAGGTACCGGATGGCAAC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CAGCTGATCGTCCTCGCAGTGACAGACCACGTGTAACAACACCTGCACAGGATCGGTACATCCGAACATCACACCTGCGGGACAGGTACCGGATGGCAAC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q CAGCTGATCGTCCTCGCAGTGACAGACCACGTGTAACAACACCTGCACAGGATCGGTACATCCGAACATCACACCTGCGGGACAGGTACCGGATGGCAAC 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 Contig_1 AACAACTGCCCGAGTTACACCAGGAACGCACAATCCCTCCATCAGTGCTCAGACTGTCTGCAATAGGCTAAGAGAGGTTGGACTGAGGGCTTGTAGGCCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: AACAACTGCCCGAGTTACACCAGGAACGCACAATCCCTCCATCAGTGCTCAGACTGTCTGCAATAGGCTAAGAGAGGTTGGACTGAGGGCTTGTAGGCCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q AACAACTGCCCGAGTTACACCAGGAACGCACAATCCCTCCATCAGTGCTCAGACTGTCTGCAATAGGCTAAGAGAGGTTGGACTGAGGGCTTGTAGGCCT 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 Contig_1 GTTGTCAGGCAGGTCATCACCGGCAACCCCTTCAACTATGGGCACAAACCCACCGTCACTGGACCAGACACTCGCGGTTTTGTCTCACCAGGGGTGATGG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTTGTCAGGCAGGTCATCACCGGCAACTCCTTCGCCTATGGGCACAAACCCACCGTCACTGGACCAGACATTCGCGGTTTTGTCTCACCAGGGGTGATGG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GTTGTCAGGCAGGTCATCACCGGCAACTCCTTCGCCTATGGGCACAAACCCACCGTCACTGGACCAGACATTCGCGGTTTTGTCTCACCAGGGGTGATGG 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 Contig_1 TCGGAATTGCGTTTATCGTTGAAGGAATGAGCGTTACACTGAGGCCTGTACTCTGGAGCGGGATCGATTTGGAGGTGGAGGGTCCGTCATGGTCTGGGGC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TCGGAATTGCGTTTATCGTTGAAGGAATGAGCGTTACACTGAGGCCTGTACTCTGGAGCGGGATCGATTTGGAGGTGGAGGGTCCGTCATGGTCTGGGGC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TCGGAATTGCGTTTATCGTTGAAGGAATGAGCGTTACACTGAGGCCTGTACTCTGGAGCGGGATCGATTTGGAGGTGGAGGGTCCGTCATGGTCTGGGGC 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 Contig_1 GGTGTATCACAGCATCATCGGACTGAGCTTGTTGTCTTTGCAGGAAATCTCAACGCTGCGCGTTACAGGGAAGACATCCTCCTCCCTCATATGGTACCCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GGTGTATCACAGCATCATCGGACTGAGCTTGTTGTCTTTGCAGGAAATCTCAACGCTGTGCGTTACAGGGAAGACATCCTCCTCCCTCATATGGTACCCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GGTGTATCACAGCATCATCGGACTGAGCTTGTTGTCTTTGCAGGAAATCTCAACGCTGTGCGTTACAGGGAAGACATCCTCCTCCCTCATATGGTACCCT 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 Contig_1 TCCTGCAGGCTCATCCTGACATGACCCTCCAGCATGACAATGCCACCAGCCATACTGCTCATGTTGTGCGTAATTTCCTGCAAGACAGGAATGTCAGTGT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TCCTGCAGGCTCATCCTGACATGACCCTCCAGCATGACAATGCCACCAGCCATACTGCTCATGTTGTGCGTGATTTCCTGCAAGACAGGAATGTCAGTGT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TCCTGCAGGCTCATCCTGACATGACCCTCCAGCATGACAATGCCACCAGCCATACTGCTCATGTTGTGCGTGATTTCCTGCAAGACAGGAATGTCAGTGT 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 Contig_1 TCTGCCATGGCCAGCGAAGAGCCCAGATCTCAATCCCATTGAGCACGTCTGGGACCTTTTGGATCGGAGGGTGAGAGCTAGGGCCATTCGCCACAGAAAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TCTGCCATGGCCAGCGAAGAGCCCAGATCTCAATCCCATTGAGCACGTCTGGGACCTTTTGGATCGGAGGGTGAGAGCTAGGCCCATTCGCCACAGAAAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TCTGCCATGGCCAGCGAAGAGCCCAGATCTCAATCCCATTGAGCACGTCTGGGACCTTTTGGATCGGAGGGTGAGAGCTAGGCCCATTCGCCACAGAAAT 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 Contig_1 GTCTGGGAACTTGCAGGTGCCTTGGTGGAAGAGTGGGGTAACATCTCACAGCAAGAACTGGCAAATCTGGTGCAGTCCATGAGGAGGAGATGCACTGCAG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTCTGGGAACTTGCAGGTGCCTTGGTGGAAGAGTGGGGTAACATCTCACAGCAAGAACTGGCAAATCTGGTGCAGTCCATGAGGAGGAGATGCACTGCAG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GTCTGGGAACTTGCAGGTGCCTTGGTGGAAGAGTGGGGTAACATCTCACAGCAAGAACTGGCAAATCTGGTGCAGTCCATGAGGAGGAGATGCACTGCAG 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 Contig_1 TACTTAATGCAGCTGGTGGCCACACCAGATACTGACTGTTACTTTTGATTTTGACCCCACCTTTGTTCAGGGACACATTATTCCATTTCTGTTAGTCACA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TACTTAATGCAGCTGGTGGCCACACCAGATACTGACTGTTACTTTTGATTTTGACCCCACCTTTGTTCAGGGACACATTATTCCATTTCTGTTAGTCACA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TACTTAATGCAGCTGGTGGCCACACCAGATACTGACTGTTACTTTTGATTTTGACCCCACCTTTGTTCAGGGACACATTATTCCATTTCTGTTAGTCACA 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 Contig_1 TGTCTGTGGAACTTGTTCAGTTTATGTCTCAGTTGTTGAATATTGTTATGTTCATACAAATATTTACACATGTTAAGTTGACTGAAAATAAACGCAGTTG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TGTCTGTGGAACTTGTTCAGTTTATGTCTCAGTTGTTGAATATTGTTATGTTCATACAAATATTTACACATGTTAAGTTGACTGAAAATAAACGCAGTTG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TGTCTGTGGAACTTGTTCAGTTTATGTCTCAGTTGTTGAATATTGTTATGTTCATACAAATATTTACACATGTTAAGTTGACTGAAAATAAACGCAGTTG 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 Contig_1 ACAGTGAGAGGACGTTTCTTTTAACAGTGAGAGGAGTTTAGTATAATTAAGTCAGGGACTAGGTAACACAAATTACCACCAAACACAATAAGTATCAAAC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: ACAGTGAGAGGACGTTTCTTTTAACAGTGAGAGGAGTTTAGTATAATTAAGTCAGGGACTAGGTAACACAAATTACCACCAAACACAATAAGTATCAAAC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q ACAGTGAGAGGACGTTTCTTTTAACAGTGAGAGGAGTTTAGTATAATTAAGTCAGGGACTAGGTAACACAAATTACCACCAAACACAATAAGTATCAAAC 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 Contig_1 TAAACATTGTTATAACTAAAATAAAATCAGGGTGACAGATTAAGTAACATAAAATATGTCATTAAAAAAAATGACCGTAGACATACAGTACTAGTCAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TAAACATTGTTATAACTAAAATAAAATCAGGGTGACAGATTAAGTAACATAAAATATGTCATTAAAAAAAATGACCGTAGACATACAGTACTAGTCAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TAAACATTGTTATAACTAAAATAAAATCAGGGTGACAGATTAAGTAACATAAAATATGTCATTAAAAAAAATGACCGTAGACATACAGTACTAGTCAAAA 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 Contig_1 GTTTGGACATACTTAGAGGTGTGGGTTTTTCTTTATTTTTACTATTCTCTACATTGTAGCATAATAGTGAAGACATAAACTATGAAATAACAAATATGGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTTTGGACATACTTAGAGGTGTGGGTTTTTCTTTATTTTTACTATTTTCTACATTGTAGCATAATAGTGAAGACATAAACTATGAAATAACAAATATGGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GTTTGGACATACTTAGAGGTGTGGGTTTTTCTTTATTTTTACTATTTTCTACATTGTAGCATAATAGTGAAGACATAAACTATGAAATAACAAATATGGA 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 Contig_1 ATCATGTAGTAACCAAAATAGTATTTAAAAAATCTAAATATATTTCAGATTTTTCAAAGTAGCCACCCTTTGCCTCGATGACAGCTTTGCACTCTCTTGG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: ATCATGTAGTAACCAAAATAGTATTTAAAAAATCTAAATATATTTCAGATTTTTCAAAGTAGCCACCCTTTGCCTCGATGACAGCTTTGCACTCTCTTGG ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q ATCATGTAGTAACCAAAATAGTATTTAAAAAATCTAAATATATTTCAGATTTTTCAAAGTAGCCACCCTTTGCCTCGATGACAGCTTTGCACTCTCTTGG 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 Contig_1 CATTCTCTCTTCACCTGGAATGCTTTTCCAAGAGTGTGCAAAACTGTCATCAAGGCAAAGGGTGACTACTTTAAAGAATGTCAAATATAAAATATATTTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CATTCTCTCTTCACCTGGAATGCTTTTCCAAGAGTGTGCAAAACTGTCATCAAGGCAAAGGGTGACTACTTTAAAGAATGTCAAATATAAAATATATTTT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q CATTCTCTCTTCACCTGGAATGCTTTTCCAAGAGTGTGCAAAACTGTCATCAAGGCAAAGGGTGACTACTTTAAAGAATGTCAAATATAAAATATATTTT 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 Contig_1 GATTTGTTTTATACTTTTTGGGTTACTACATGATTCCATATGTGTTATTTAATAGTTTTGAAGTCTTCACTATTATTCTACAATGTAGAAAATAGTAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GATTTGTTTTATACTTTTTGGGTTACTACATGATTCCATATGTGTTATTTAATAGTTTTGAAGTCTTCACTATTATTCTACAATGTAGAAAATAGTAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GATTTGTTTTATACTTTTTGGGTTACTACATGATTCCATATGTGTTATTTAATAGTTTTGAAGTCTTCACTATTATTCTACAATGTAGAAAATAGTAAAA 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2600 Contig_1 TAAAGAATCCCTGGAATAAGTAGGTGTGTCCAAACTTTTGACTGGTACTGTACGTGTTTGGTATCATATAGCTAGTAGTTACAAAAGTAAACTCATTTAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TAAAGAATCCCTGGAATAAGTAGGTGTGTCCAAACTTTTGACTGGTACTGTACGTGTTTGGTATCATATAGCTAGTAGTTACAAAAGTAAACTCATTTAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TAAAGAATCCCTGGAATAAGTAGGTGTGTCCAAACTTTTGACTGGTACTGTACGTGTTTGGTATCATATAGCTAGTAGTTACAAAAGTAAACTCATTTAA 2610 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2700 Contig_1 AAGCTTGAAACGTAGAATTTGTCCCTCAGAATTATGTCCACTCTGAAAATCTAGTGTCTTATCATGATTTTCAAAGTAAAATATAAAACAAGTTAGTGAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: AAGCTTGAAACGTAGAATTTGTCCCTCAGAATTATGTCCACTCTGAAAATCTAGTGTCTTATCATGATTTTCAAAGTAAAATATAAAACAAGTTAGTGAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q AAGCTTGAAACGTAGAATTTGTCCCTCAGAATTATGTCCACTCTGAAAATCTAGTGTCTTATCATGATTTTCAAAGTAAAATATAAAACAAGTTAGTGAA 2710 2720 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 Contig_1 GTAAAATTATATACAGAGATTACTGAGAAACATGCAGCAAAATCATCCCAGAAGAATTACATAAGATTGCATTCATAAAAAATTATGATGAGATGACTGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTAAAATTATATACAGAGATTACTGAGAAACATGCAGCAAAATCATCCCAGAAGAATTACATTAAATTGCATTCATAAAAAATTATGATGAGATGACTGA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q Contig1S7cDNA S7 4000 C1q GTAAAATTATATACAGAGATTACTGAGAAACATGCAGCAAAATCATCCCAGAAGAATTACATTAAATTGCATTCATAAAAAATTATGATGAGATGACTGA 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 2890 2900 Contig_1 CTCAATATTTGGCATTGTTGGATGAGTGTTATGCAACATTCAAATGGATTTCCCTCTTGTTAGTTAGTACCTGTAATTGGGTTGTAGGCCTTGCCGATGT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CTCAATATTTGGCATTGTTGGATGAATGTTATGCAACATTCAAATGGATTTCCCTCTTGTTAGTTAGTACCTGTAATTGGGTTGTAGGCCTTGCCGATGT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q CCTGTAATTGGGTTGTAGGCCTTGCCGATGT Contig1S7cDNA CCTGTAATTGGGTTGTAGGCCTTGCCGATGT S7 4000 C1q CTCAATATTTGGCATTGTTGGATGAATGTTATGCAACATTCAAATGGATTTCCCTCTTGTTAGTTAGTACCTGTAATTGGGTTGTAGGCCTTGCCGATGT 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2970 2980 2990 3000 Contig_1 TGGTGATGACTCTACTGAAGATCAGTGTAGTAGCAGTACTGAATGGACCTACGTTTCCAGAGTCAGTCAAACCAGCAGAGAAGGCCACAGTTGGTCTGCC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TGGTGATGACTCTACTGAAGATCAGTGTAGTAGCAGTACTGAATGGACCTACGTTTCCAGAGTCAGTCAAACCAGCAGAGAAGGCCACAGTTGGTCTGCC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q TGGTGATGACTCTACTGAAGATCAGTGTAGTAGCAGTACTGAATGGACCTACGTTTCCAGAGTCAGTCAAACCAGCAGAGAAGGCCACAGTTGGTCTGCC Contig1S7cDNA TGGTGATGACTCTACTGAAGATCAGTGTAGTAGCAGTACTGAATGGACCTACGTTTCCAGAGTCAGTCAAACCAGCAGAGAAGGCCACAGTTGGTCTGC S7 4000 C1q TGGTGATGACTCTACTGAAGATCAGTGTAGTAGCAGTACTGAATGGACCTACGTTTCCAGAGTCAGTCAAACCAGCAGAGAAGGCCACAGTTGGTCTGCC 3010 3020 3030 3040 3050 3060 3070 3080 3090 3100 Contig_1 TGTGAAAAGAAGTTGATTATTTAAAAGGACAATCTGAGATTGAAATAACAACAAGGCAAATGCTTACTTATCCACCTGTATCAATCCAATTTACAAATGC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: TGTGAAAAGAAGTTGATTATTTAAAAGGACAATCTGAGATTGAAATAACAACAAGGCAAATGCTTACTTATCCACCTGTATCAATCCAATTTACAAATGC ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q TG Contig1S7cDNA S7 4000 C1q TGTGAAAAGAAGTTGATTATTTAAAAGGACAATCTGAGATTGAAATAACAACAAGGCAAATGCTTACTTATCCACCTGTATCAATCCAATTTACAAATGC 3110 3120 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 Contig_1 CTGATATTTCTGACATGACCTGCTTTCTCTTTCTCCAGCTCTTCCACCTTGCTCTTCTGGAGCTGCAGTTCAGTCTTGGTGACGCTCAGCTCCTGTCTCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CTGATATTTCTGACATGACCTGCTTTCTCTTTCTCCAGCTCTTMCACCTTGCTCTTCTGGAGCTGCAGTTCAGTCTTGGTGACGCTCAGCTCCTGTCTCT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q CTTTCTCTTTCTCCAGCTCTTCCACCTTGCTCTTCTGGAGCTGCAGTTCAGTCTTGGTGACGCTCAGCTCCTGTCTCT Contig1S7cDNA ACCTTGCTCTTCTGGAGCTGCAGTTCAGTCTTGGTGACGCTCAGCTCCTGTCTCT S7 4000 C1q CTGATATTTCTGACATGACCTGCTTTCTCTTTCTCCAGCTCTTACACCTTGCTCTTCTGGAGCTGCAGTTCAGTCTTGGTGACGCTCAGCTCCTGTCTCT 3210 3220 3230 3240 3250 3260 3270 3280 3290 3300 Contig_1 GTTCCACCATCATGTCTCTCAGCTCCTCCAGCTTAGACCAGATGTCAGGGGTCTTGTGGGCCGTCTCTGTAGCTTCAGCCCATGCCCCAAACAGAGAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: GTTCCACCATCATGTCTCTCAGCTCCTCCAGCTTAGACCAGATGTCAGGGGTCTTGTGGGCCGTCTCTGTAGCTTCAGCCCATGCCCCAAACAGAGAAAA ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q GTTCCACCATCATGTCTCTCAGCTCCTCCAGCTTAGACCAGATGTCAGGGGTCTTGTGGGCCGTCTCTGTAGCTTCAGCCCATGCCCCAAACAGAGAAAA Contig1S7cDNA GTTCCACCATCATGTCTCTCAGCTCCTCCAGCTTAGACCAGATGTCAGGGGTCTTGTGGGCCGTCTCTGTAGCTTCAGCCCATGCCCCAAACAGAGAAAA S7 4000 C1q GTTCCACCATCATGTCTCTCAGCTCCTCCAGCTTAGACCAGATGTCAGGGGTCTTGTGGGCCGTCTCTGTAGCTTCAGCCCATGCCCCAAACAGAGAAAA 3310 3320 3330 3340 3350 3360 3370 3380 3390 3400 Contig_1 CAGCAGCAGAGCTACAGCACCTCTCATTCTGAAACGACACATCTTCTGAAATGATCTAGTCTTTGAGGCTAGAAATTTACAGGATTAAAGTAGGAGCTAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Consensus: CAGCAGCAGAGCTACAGCACCTCTCATTCTGAAACGACACATCTTCTGAAATGATCTAGTCTTTGAGGCTAGAAATTTACAGGATTAAAGTAGGAGCTAT ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ C1q CAGCAGCAGAGCTACAGCACCTCTCATTCTGAAACGACACATCTTCTGAAATGATCTAGTCTTTGAGGCTAGAAATTTACAGGATTAAAGTAGGAGCTAT Contig1S7cDNA CAGCAGCAGAGCTACAGCACCTCTCATTCTGAAACGACACATCTTCTGAAATGATCTAGTCTTTGAGGCTAGAAATTTACAGGATTAAAGTAGGAGCTAT S7 4000 C1q CAGCAGCAGAGCTACAGCACCTCTCATTCTGAAACGACACATCTTCTGAAATGATCTAGTCTTTGAGGCTAGAAATTTACAGGATTAAAGTAGGAGCTAT Contig_1 ATCTGTG ~~~~~~~ Consensus: ATCTGTG ~~~~~~~ C1q ATCTGTG Contig1S7cDNA ATCTGTG S7 4000 C1q ATCTGTG