Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold962 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1469792

Tables:   1   2   3   4   

This is table  1  of  4  ( 424 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14838--14879
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3.3
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1.93
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499
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
A
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(0-2)
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Size
Copy
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Score
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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25
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57
34
24
41
0
1.55
335509--335684
4
43.5
4
82
2
145
49
10
39
1
1.44
335578--335616
15
2.6
14
91
0
51
46
15
33
5
1.68
337593--337633
1
41.0
1
90
0
64
0
0
4
95
0.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
337586--337626
13
3.2
13
90
10
59
0
0
9
90
0.46
342178--342227
11
4.6
11
92
2
75
28
28
10
34
1.89
342597--342628
2
16.0
2
100
0
64
0
50
0
50
1.00
342843--343065
112
2.0
112
97
0
419
32
19
19
29
1.96
344082--344131
11
4.5
11
94
0
91
32
8
32
28
1.86
344163--344191
11
2.6
11
100
0
58
31
10
31
27
1.90
344257--344288
11
2.9
11
95
0
55
34
9
28
28
1.88
344294--344332
11
3.6
11
82
6
53
30
23
7
38
1.83
361743--361776
12
2.8
12
86
4
50
52
32
14
0
1.42
361743--361775
15
2.1
16
94
5
59
54
33
12
0
1.37

Tables:   1   2   3   4