Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold601 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1259944

Tables:   1   2   3   4   5   

This is table  1  of  5  ( 521 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
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Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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312
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14
16
34
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
195179--195439
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15
14
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1.88
196097--196371
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87
5
609
23
23
18
34
1.96
234631--235095
190
2.5
183
88
3
673
23
23
18
34
1.97
235347--235421
34
2.2
34
97
0
141
33
6
24
36
1.81
236188--236323
46
3.0
46
97
0
254
14
23
30
31
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
240687--240729
22
2.0
22
100
0
86
46
9
13
30
1.75
247741--247832
41
2.2
42
92
1
150
30
55
8
5
1.53
252416--252502
21
4.2
21
69
7
70
40
13
18
27
1.88
252580--252817
21
11.3
21
79
3
203
31
16
13
37
1.88
253017--253112
21
4.6
21
68
5
68
33
14
18
33
1.91
253017--253112
42
2.3
42
90
3
158
33
14
18
33
1.91
253203--253305
21
4.9
21
76
4
109
39
16
16
27
1.90
253270--253375
42
2.5
42
81
0
122
33
18
15
32
1.92
253518--253557
21
1.9
21
89
0
62
27
22
12
37
1.90
253475--253554
42
1.9
42
86
0
115
30
21
15
33
1.94

Tables:   1   2   3   4   5