Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold168 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1096678

Tables:   1   2   3   

This is table  2  of  3  ( 245 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
567200--567279
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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34
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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5
25
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
896922--897007
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2
127
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5
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1.74
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2.7
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22
8
24
1.81
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23
1.88
1002249--1002284
16
2.2
16
100
0
72
36
11
11
41
1.76
1003387--1003413
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
1009085--1009125
2
20.5
2
100
0
82
0
51
0
48
1.00
1013076--1013102
13
2.1
13
100
0
54
62
22
7
7
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1013568--1013620
26
2.0
26
88
0
79
33
32
5
28
1.81
1017248--1017374
2
63.5
2
94
0
137
48
42
8
0
1.39
1017381--1017418
2
19.0
2
100
0
76
50
0
50
0
1.00
1019181--1019210
1
30.0
1
100
0
60
0
0
0
100
0.00
1043920--1044228
165
1.9
164
80
9
369
34
14
18
32
1.91
1044110--1044411
165
1.8
166
79
7
355
35
14
19
30
1.92
1045448--1045527
21
3.8
21
88
4
117
26
8
23
41
1.83
1045551--1045585
10
3.5
10
88
0
52
25
8
25
40
1.84
1045789--1045864
21
3.6
21
96
0
134
27
14
21
36
1.92
1060862--1060906
14
3.2
14
87
12
74
22
26
11
40
1.87

Tables:   1   2   3