Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold149 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1065560

Tables:   1   2   3   4   

This is table  3  of  4  ( 442 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Indices
Period
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
A
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
116
50
0
50
0
1.00
888971--889042
4
18.0
4
91
0
54
36
25
38
0
1.56
889040--889070
4
7.8
4
92
0
53
29
22
48
0
1.51
889702--889799
32
3.1
32
100
0
196
24
44
12
18
1.84
895682--895725
18
2.4
18
85
10
63
52
20
4
22
1.65
899225--899357
28
4.9
28
85
7
184
43
17
19
19
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
901297--901363
20
3.4
20
91
0
98
19
14
28
37
1.91
901311--901374
20
3.2
20
90
0
92
15
12
32
39
1.85
901877--902070
20
9.6
20
89
3
280
15
11
27
44
1.82
902177--902204
2
14.0
2
100
0
56
50
0
50
0
1.00
904368--904402
14
2.5
14
95
0
61
40
11
11
37
1.77
905668--905713
2
23.0
2
100
0
92
50
0
50
0
1.00
906634--906671
12
3.2
12
85
3
51
2
39
23
34
1.69
906841--907663
166
5.0
159
86
8
1005
38
18
16
26
1.92
906841--907663
324
2.5
322
87
7
1149
38
18
16
26
1.92
908972--909133
81
2.0
81
80
8
186
31
16
20
32
1.94

Tables:   1   2   3   4