Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold1017 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1024007

Tables:   1   2   3   4   

This is table  3  of  4  ( 364 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
661347--661393
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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33
1.93
937515--937547
2
16.5
2
100
0
66
0
51
0
48
1.00
938477--938535
27
2.2
27
100
0
118
27
10
35
27
1.89
941875--942138
38
7.0
38
96
0
476
26
21
18
34
1.96
943427--943459
16
2.1
16
94
0
57
33
24
12
30
1.91
953721--954326
34
17.9
34
87
3
737
27
10
37
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
954366--954436
34
2.1
34
97
0
133
25
11
39
23
1.88
954254--954476
112
2.0
111
90
0
347
31
8
34
24
1.86
954677--954707
13
2.5
13
94
5
55
35
6
0
58
1.24
954686--954719
18
1.9
17
94
5
59
32
5
2
58
1.37
956798--957173
193
1.9
189
91
7
605
41
12
12
33
1.81
967391--967446
2
28.0
2
92
0
94
0
46
3
50
1.19
968320--968352
17
1.9
17
100
0
66
30
24
21
24
1.99
986655--986685
2
15.5
2
100
0
62
48
0
51
0
1.00
987913--988109
63
3.1
63
87
2
243
35
14
10
40
1.80
987993--988091
31
3.2
31
64
7
74
31
20
9
39
1.83

Tables:   1   2   3   4