Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.04
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: scaffold86 Parameters: 2 7 7 80 10 50 500 Length: 1697160

Tables:   1   2   3   4   5   6   

This is table  5  of  6  ( 603 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1281268--1281316
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37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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29
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11
24
40
1.87
1635129--1635158
11
2.7
11
100
0
60
0
0
10
90
0.47
1635621--1635680
2
30.0
2
100
0
120
50
0
50
0
1.00
1635738--1635768
2
15.5
2
100
0
62
51
0
48
0
1.00
1641993--1642148
76
2.1
76
98
0
303
29
8
17
43
1.80
1646534--1646567
16
2.1
16
94
0
59
50
11
0
38
1.39
1649578--1649791
19
11.5
18
66
12
83
20
15
23
40
1.90
1649707--1649791
37
2.3
36
78
9
91
21
12
24
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1660622--1660677
28
2.0
28
100
0
112
32
14
21
32
1.93
1660624--1660686
28
2.2
28
91
5
101
33
14
22
30
1.93
1665171--1666256
166
6.5
166
86
3
1481
34
15
23
25
1.94
1665173--1666256
335
3.3
330
85
4
1495
34
15
23
26
1.95
1670066--1670142
36
2.1
37
97
2
147
37
20
16
24
1.93
1683291--1683325
2
17.5
2
100
0
70
48
0
51
0
1.00
1686270--1686440
86
2.0
86
100
0
342
28
19
17
33
1.95
1686648--1687513
166
5.2
166
94
2
1418
32
15
25
26
1.96
1686648--1687513
331
2.6
332
93
2
1436
32
15
25
26
1.96
1692109--1692138
12
2.5
12
88
0
51
50
6
10
33
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6