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19 | 1835 | Cg_SACSIN_F | ACTCTGGCACCATCCAGTTATC | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 22 | SACSIN | CGI_10019897 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
20 | 1834 | Cg_SACSIN_R | CTCCTGAGAAGGCCTTTAGACA | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 22 | SACSIN | CGI_10019897 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
21 | 1833 | Cg_IRF2_F | CGAAACGCAGAAACTGTTC | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 19 | IRF-2 | CGI_10021170 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
22 | 1832 | Cg_IRF2_R | ATTTGCCTTCCATCTTTTGG | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 20 | IRF-2 | CGI_10021170 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
23 | 1831 | Cg_DICER_F | ACGTCGGTAGCAGAGGAAGG | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 20 | DICER | CGI_10020752 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
24 | 1830 | Cg_DICER_R | CTTCCTCCATCTTCTCACTGC | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 21 | DICER | CGI_10020752 | Matt George, mngeorge@uw.edu | ||||||||||||||||||
25 | 1829 | Cg_VIPERIN_F | TAAATGCGGCTTCTGTTTCC | https://owl.fish.washington.edu/Athaliana/qPCR_data/sam_2023-07-19%2011-54-14_CFX96-Cg_VIPERIN-melt-plots.png | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 20 | VIPERIN | CGI_10018396 | Matt George, mngeorge@uw.edu | |||||||||||||||||
26 | 1828 | Cg_VIPERIN_R | CAGCTGAAGGTCCTCTTTGC | https://owl.fish.washington.edu/Athaliana/qPCR_data/sam_2023-07-19%2011-54-14_CFX96-Cg_VIPERIN-melt-plots.png | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 20 | VIPERIN | CGI_10018396 | Matt George, mngeorge@uw.edu | |||||||||||||||||
27 | 1827 | Cg_cGAS_F | TTCAAAGATGGTGCAGGAGGAG | https://owl.fish.washington.edu/Athaliana/qPCR_data/sam_2023-08-17_11-58-46_Connect-Cg_cGAS-melt-plots.png | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 22 | cGAS | CGI_10023476 | Matt George, mngeorge@uw.edu | |||||||||||||||||
28 | 1826 | Cg_cGAS_R | AGGGTCTTTCACAAGGTTCCTC | https://owl.fish.washington.edu/Athaliana/qPCR_data/sam_2023-08-17_11-58-46_Connect-Cg_cGAS-melt-plots.png | C. gigas | 2020313 | Laftont et al. 2020 | 22 | cGAS | CGI_10023476 | Matt George, mngeorge@uw.edu | |||||||||||||||||
29 | 1825 | Mg_Act_F | ATGCTCCAAGAGCCGTGTTTC | 434985988 | M.galloprovincialis | 20230309 | Salatiello et al. 2022 | 21 | beta-Actin | |||||||||||||||||||
30 | 1824 | Mq_Act_R | CTCTCTTGCTCTGGGCTTCATC | 434985989 | M.galloprovincialis | 20230309 | Salatiello et al. 2022 | 22 | beta-Actin | |||||||||||||||||||
31 | 1823 | Cg_DDX4_F | CCTGTCATCTGGGCACAATAAAATT | 420083509 | C. gigas | 20221003 | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X04002074?via%3Dihub | 25 | probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 | NC_047568.1 | ||||||||||||||||||
32 | 1822 | Cg_DDX4_R | AATTTTATTGTGCCCAGATGACAGG | 420083510 | C. gigas | 20221003 | https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X04002074?via%3Dihub | 25 | probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 | NC_047568.1 | ||||||||||||||||||
33 | 1821 | Mg_MT10_F | AGGTTGTCGCTGTGGTGAATG | 404310720 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | MT10 | AJ625847 | 1820 | 129 | ||||||||||||||||
34 | 1820 | Mg_MT10_R | CAGGAACATCCAGGTGCACAT | 404310721 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | MT10 | AJ625847 | 1821 | 129 | ||||||||||||||||
35 | 1819 | Mg_MT20_F | AATGGCTGGACCTTGTAACTGC | 404310722 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 22 | MT20 | AY566247 | 1818 | 128 | ||||||||||||||||
36 | 1818 | Mg_MT20_R | CTTTACATCCGGAACATCCGC | 404310723 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | MT20 | AY566247 | 1819 | 128 | ||||||||||||||||
37 | 1817 | Mg_small HSP24.1_F | TGTTGACAGCCCAAGGAGAAC | 404310724 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | small HSP24.1 | AJ625244 | 1816 | 167 | ||||||||||||||||
38 | 1816 | Mg_small HSP24.1_R | AACATCTTCAGCCATTGGTGC | 404310725 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | small HSP24.1 | AJ625244 | 1817 | 167 | ||||||||||||||||
39 | 1815 | Mg_SQSTM1_F | CCTTCTGTGCCAAGTACAACCA | 404310726 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 22 | SQSTM1 | AJ624024 | 1814 | 121 | ||||||||||||||||
40 | 1814 | Mg_SQSTM1_R | TCAGAAGAGAGGTCAACCAGCC | 404310727 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 22 | SQSTM1 | AJ624024 | 1815 | 121 | ||||||||||||||||
41 | 1813 | Mg_HSC70_F | GCAGCCTTGTCTAGTTTGGCA | 404310728 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | HSC70 | AJ624615 | 1812 | 103 | ||||||||||||||||
42 | 1812 | Mg_HSC70_R | GCATCACAAGAGCCAGGTTTG | 404310729 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | HSC70 | AJ624615 | 1813 | 103 | ||||||||||||||||
43 | 1811 | Mg_HSP90_F | TCATGGAGGCTCTTCAAGCTG | 404310730 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | HSP90 | AJ625915 | 1810 | 147 | ||||||||||||||||
44 | 1810 | Mg_HSP90_R | CAGCTGCCGATTCCCAGATAT | 404310731 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | HSP90 | AJ625915 | 1811 | 147 | ||||||||||||||||
45 | 1809 | Mg_ferritin_F | ATGCAGGTTGCTITGTCCTTG | 404310732 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | ferritin | AJ625268 | 1808 | 135 | ||||||||||||||||
46 | 1808 | Mg_ferritin_R | GGCGTTCACTTGTTCTTCCAA | 404310733 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | ferritin | AJ625268 | 1809 | 135 | ||||||||||||||||
47 | 1807 | Mg_GADD45 gamma_F | TCTGTTTCGGCCATCTCTGGT | 404310734 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | GADD45 gamma | AJ623737 | 1806 | 110 | ||||||||||||||||
48 | 1806 | Mg_GADD45 gamma_R | GCACAGGAAGACGGCAGAATT | 404310735 | M.galloprovincialis | 20220426 | Varotto et al. 2013 | 21 | GADD45 gamma | AJ623737 | 1807 | 110 | ||||||||||||||||
49 | 1805 | Ill_TrSq_P7_23 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCCACTCGTGACTGGAGTTCAGACGTGTG | 286930970 | IlluminaTruSeqPrimersForZymoPicoMethylKit | 20201116 | Karolyn Giang @Zymo | 52 | Barcode: CCACTC | IlluminaTruSeqPrimersForZymoPicoMethylKit | ||||||||||||||||||
50 | 1804 | Ill_TrSq_P7_25 | CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATATCAGTGTGACTGGAGTTCAGACGTGTG | 286930971 | IlluminaTruSeqPrimersForZymoPicoMethylKit | 20201116 | Karolyn Giang @Zymo | 52 | Barcode: ATCAGT | IlluminaTruSeqPrimersForZymoPicoMethylKit | ||||||||||||||||||
51 | 1803 | 28s_v1_FWD | CCGGTCCTGAAACCACCC | 280279134 | P.generosa | 8/31/2020 | SamGurr | 18 | 66.67 | 59.97 | 28s ribosomal RNA gene | PGEN_.00g142400 | 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| 4428 | 1785 | 108 | ||||||||||||
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| 8112 | 1781 | 111 | ||||||||||||
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